A actividade dos Amigos dos Açores, ao longo dos seus 20 anos de existência, tem-se desenvolvido essencialmente em quatro vertentes: a recreativa, a pedagógica, a científica e a de pressão/denúncia.
No que diz respeito à primeira, a associação promove a realização de passeios pedestres mensais para os seus associados, abertos à comunidade e a visitantes, tendo por objectivos principais: o A verificação "in loco" do estado do ambiente; o A recolha de elementos para uma futura elaboração de itinerários de descoberta da natureza e roteiros de percursos pedestres, importantes recursos para a educação ambiental e para o fomento do turismo de natureza. Como complemento a esta actividade já foram editados 16 roteiros de percursos pedestres, 15 para a ilha de São Miguel e um para a de Santa Maria. Estes roteiros, para além de serem um importante meio pedagógico para os professores que pretendem organizar visitas de descoberta da natureza, são um instrumento indispensável para os turistas que nos procuram para praticar o pedestrianismo. No que diz respeito à vertente pedagógica, para além de apoiar as escolas quer no acompanhamento de visitas de estudo quer no fornecimento de materiais de apoio para os professores e a solicitação dos alunos, a associação organiza acções de sensibilização sobre os mais diversos temas, com destaque para o património natural, a gestão das áreas protegidas, a problemática dos resíduos sólidos, etc. Ainda nesta área, a associação editou várias publicações com destaque para as seguintes:
- Grutas, Algares e Vulcões - Património Espeleológico da Ilha de São Miguel;
- Lagoas e Lagoeiros da Ilha de São Miguel;
- Lagoas e Lagoeiros do Concelho de Ponta Delgada;
- Paisagens Vulcânicas dos Açores;
- Tenente Coronel José Agostinho - cartas inéditas;
- Migrações de Aves;
- Proposta de Intervenção Museológica na Gruta do Carvão, Ilha de São Miguel;
- Memória dos Moinhos da Ribeira Grande;
- Cacos Falantes;
- O Tritão de Crista em São Miguel;
- Borboletas Nocturnas dos Açores;
- O Milhafre - Uma História Natural;
- O Mocho - Guardião das Lagoas;
- Parque Natural Regional da Plataforma Costeira das Lajes do Pico;
- Aniversol;
- Educação Científica no 1º Ciclo do Ensino Básico;
- Orientação - Jogo "A minha primeira história Natural dos Açores".
No que diz respeito à investigação, os Amigos dos Açores promovem diversas iniciativas com destaque para o estudo das aves de rapina, o estudo do tritão de crista, o inventário das zonas húmidas de São Miguel e o levantamento fotográfico e topográfico das grutas e algares da ilha de São Miguel. Relativamente à vertente da pressão/denúncia, destaca-se a apresentação de petições ou memorandos aos órgãos de poder, a nível nacional, regional e autárquico, a denúncia de situações através da comunicação social e o envio de propostas de classificação de Áreas Protegidas, como foi o caso da Gruta do Carvão, da Ponta da Ferraria e das Lagoas do Congro e Nenúfares.
A associação tem desenvolvido trabalho junto dos jovens, quer promovendo iniciativas a eles destinados quer na colaboração com diversas associações juvenis da ilha de São Miguel, apresentando exposições temáticas e na organização de acções de sensibilização.